في إطار الدور التثقيفي لمتحف المخطوطات بمكتبة الإسكندرية والاهتمام الذي يوليه لجميع فئات المجتمع، ينظم المتحف بالتعاون مع وحدة برامج ذوي الاحتياجات الخاصة بالمكتبة، برنامجًا شهريًا يضم ورش عمل تثقيفية تفاعلية لذوى الاحتياجات الخاصة من جميع الأعمار، والتي تأتي تحت عنوان "رحلة داخل مخطوط"؛ وذلك بهدف تعريفهم على التراث العربي والإسلامي وتعريفهم بالذخائر التراثية ونوادر الكتب والمخطوطات بطريقة مبسطة.

تتناول ورش العمل مجموعة من المحاضرات للتعريف ببعض المعروضات الموجودة داخل قاعة عرض متحف المخطوطات، ونماذج من الكتابات المتعددة بداية من كتاب الموتى، واللغات المستخدمة في الحضارة الفرعونية من خلال حجر رشيد، وكذلك التعرف على أدوات كتابة المخطوط العربي وصناعة الورق، وأشكال اللغة العربية وتطورها، وكيفية تزيين وتذهيب المخطوطات، والأشكال الهندسية التي استخدمت في المخطوط العربي. كما تركز ورش العمل على الجانب العملي من خلال تدريب ذوي الاحتياجات الخاصة على الكتابة الهيروغليفية وكيفية عمل نماذج للبرديات.